同型半胱酸高主要是遗传因素，比如基因的缺陷、突变，导致高同型半胱氨酸代谢必需的酶缺乏。营养的影响，比如维生素B6、维生素B12、叶酸的摄入不足，也会引起高同型半胱氨酸在体内堆积。摄入大量的咖啡、酒精、吸烟等，也会导致同型半胱氨酸的升高。