小儿先天性膈疝的鉴别诊断：第一，小儿先天性膈疝与肺部疾病的鉴别诊断，如重症肺炎、肺畸形、肺囊腺瘤、孤立性肺等。一般可以通过CT检查来区分；第二，小儿先天性膈疝与食管短的区别，在这种情况下，术前检查无法区分，而且大多是通过术中观察来鉴别。