儿童消化道畸形通常通过手术治疗。目前最常用的手术方法是微创手术，其复发率低，治愈率达80%以上。儿童有多种消化道畸形，因为整个消化道都可能畸形。常见的消化道畸形包括十二指肠闭锁、十二指肠狭窄、幽门梗阻、空肠闭锁、回肠闭锁、结肠畸形等。