肺脓肿的主要鉴别疾病有四种：第一，支气管肺癌，也可有空洞，是一种隐匿性疾病，患者发热较少；第二，肺结核也可以发烧，但它主要是一种传染病，在痰中可以发现抗酸杆菌；第三，原发支气管是肺囊肿的继发感染。囊肿可能从很小的时候就存在，并且可以帮助识别它；第四，细菌性肺炎和早期细菌性肺炎的胸片与肺脓肿非常相似，需要进行鉴别。