原发性肺动脉高压有两种外科治疗方法。一种是心房造瘘术，即在心房之间形成一个瘘管，将部分血液从心房分流出来，缓解肺循环压力。它可以作为移植前的过渡手术；另一种是移植，包括肺移植和心肺联合移植，适用于严重心力衰竭或复发性晕厥患者，以及心脏指数低于1.5升/千克体重、血氧饱和度低于63%的患者。