肾脓肿最严重的并发症是败血症，以及由败血症引起的其他器官疾病，出现发热，高烧不退。严重的情况下可以导致死亡。由肾脓肿引起的其他器官疾病，如肺脓肿和肝脓肿，也是并发症。肾脓肿穿透肾脏，沿输尿管蔓延至膀胱下部，可导致急性膀胱炎；如果出现这些并发症，我们应该积极治疗并发症以及肾脓肿。