小切口白内障手术有很多并发症，手术后与切口相关的眼部不适的常见症状，包括异物感、干涩、畏光和流泪，都是暂时现象，可以通过药物或时间缓解；另一种罕见的并发症是术后眼内感染引起的眼内炎，应在术前用液体药物治疗，并在术后及时复查，以防止眼内感染的发生。长期来看，小切口白内障手术和微创白内障超声乳化手术之间没有显著差异。