射精后腰酸说明存在生殖系统的炎症。除了炎症分泌物对泌尿系统存在着刺激以外，炎症会引起这些器官的充血水肿，引起腰背部酸痛。有些慢性炎症患者，平常症状并不严重，但性生活时性器官会有充血，而这种充血会导致原有的充血水肿更加明显；射精时由于射精相关肌肉的运动，会导致炎性分泌物更多地分泌。由于性生活中炎性分泌物增多、性器官充血水肿加重，所以射精后，原本不明显的腰酸背痛症状会明显出现。