治疗跖疣最有效的方法取决于疣的大小和数量以及接受方式。常用的方法有：冷冻法、电离子法、二氧化碳激光治疗、手术切除、口服抗病毒药物+外敷抗病毒软膏治疗、以及中药加温浸泡治疗。单跖疣可用冷冻、CO2激光等直接方法治疗；多跖疣可用冷冻内服或中药加热浸泡等方法治疗。