复方黄连素的作用是清热燥湿，行气止痛，用于大肠湿热，赤白下痢，里急后重，主要是急慢性肠炎、痢疾可见上述表现，复方黄连素片针对防治高血压、高血脂症、糖尿病、心律失常也有很好作用，且还有防癌作用；另外复方黄连素的副作用是导致便秘，大量服用会导致厌恶，吐逆，皮疹及发热等。