第一，发生部位。骶尾部囊肿只会发生在骶尾部，确切的讲是在尾骨尖附近，一般对应骶骨裂孔；肛瘘则发生在肛门周围，一般来说，距离及骶尾部还有一段距离。 第二，发病原因。骶尾部脓肿多是以尾部藏毛窦感染的常见症状，鸡骶尾部藏毛窦感染的发病原因现在不是特别清楚，主要原因考虑为先天因素、久坐、肥胖、骶尾部外伤等等；肛瘘的发病原因多数情况下是因干肛腺感染，没有控制好诱发的。 第三，临床症状。骶尾部藏毛窦感染是在骶尾部出现的皮下包块、红肿、疼痛，后期会出现破溃流脓，复发作；而肛瘘是肛周发生的肉芽肿性管道由内口瘘管外口，三部分组成。