小的甲状腺囊肿有可能会自愈，比如在几毫米左右，但是如果甲状腺囊肿比较大，比如在两公分了，或者更大的甲状腺囊肿自愈的可能性就非常小。大部分甲状腺囊肿是在结节性甲状腺肿的基础之上而形成的，有可能囊肿比较小，定期复查，比如患者要清淡饮食，要多吃新鲜蔬菜、水果，小的囊肿有可能会消失；但是如果囊肿比较大，或者囊肿内部有出血，导致囊肿突然增大，并且有可能会激发感染，导致囊肿有疼痛，就建议患者要手术切除，一般要将单侧甲状腺腺叶完整切除，并且常规要做病理学检查。