肛瘘手术是中型手术。手术容易术后复发，而复杂的肛瘘，手术难度比较大，且易造成严重的术后并发症，如肛门狭窄导致排便困难。此外，它还会导致肛门畸形。肛门失去收缩功能后，肛门不能闭合，从而导致大便失禁。因此，手术应在正规专科医院进行，不得随意选择非专业人员进行手术。