肛门闭锁必须手术治疗。儿童肛门闭锁是一种急症，手术是唯一的治疗方法。如果不进行手术，大便不能有效排出，儿童不能正常进食、提供营养和代谢。孩子的存活期不超过2周。一旦发现孩子有肛门闭锁，他们应该立即去专科医院治疗。肛门闭锁的儿童可以进行肛门整形手术或会阴手术。也可以先进行结肠造口术以解决排便问题，然后在儿童3-6个月大时进行瘘管闭合和肛门成形术。