肛瘘诊断中最重要的是肛门指诊诊断，它可以基本判断肛瘘的方向和位置。然而，其他特别复杂的方法，不能只靠手指诊断，需要我们相对特殊的检查方法，如底管造影，然后我们可以通过x光片看到瘘管的方向。另外，我们可以对盆进行核磁检查，这是一个非常重要的方法，我们可以看到肛瘘的侵犯程度。