胃肠道间质瘤常发生在胃、小肠、直肠和结肠，可通过胃镜、结肠镜和全腹部增强CT进行诊断。恶性胃肠道间质瘤容易转移到肝脏和腹腔。CT和MRI可以初步判断肿瘤是否与间质瘤有关。如果怀疑腹腔其他部位有转移，且CT不能完全确定，可以考虑正电子发射断层扫描，但正电子发射断层扫描价格昂贵，不是首选，应在医生指导下进行检查。